hsa-miR-197靶基因预测及生物信息学特征分析

• 作者: 应小燕 徐青 皇甫玉爽
• 来源期刊: 江苏医药
• 学科: 医学
• 关键词: hsa-miR-197 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 398-401
• 分类号: R346
• 语种: 中文

摘要

目的 通过对hsa-miR-197进行系统的生物信息学分析,预测其靶基因、相关功能及其可能参与的生物学过程.方法 通过PubMed检索hsa-miR-197相关文献；通过miRBase、NCBI等在线数据库获取并分析hsa-miR-197序列保守性及其基因组特征.通过GO功能注释、GO富集分析和信号转导通路富集分析,选择miRanda、TargetScan及PicTar预测hsa-miR-197的靶基因的交集作为分析的基因集合.结果 (1) hsa-miR-197在人类同源的物种间具有高度保守性.(2)三种方法预测结果取交集获得hsa-miR-197可能的靶基因共有32个.(3) hsa-miR-197靶基因主要参与DNA修复、蛋白磷酸化、离子转运、蛋白修饰、DNA依赖的转录调控等生物学过程,涉及Wnt、氨基糖类代谢等信号转导通路.结论 hsa-miR-197的功能较广泛,与发育、代谢等密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	应小燕	南京医科大学第二附属医院东院妇产科	70	548	11.0	21.0
2	徐青	南京医科大学附属南京市妇幼保健院妇科	80	496	12.0	16.0
3	皇甫玉爽	南京医科大学第二附属医院东院妇产科	4	25	2.0	4.0