蛋白质相互作用网络功能模块检测的研究综述

• 作者: 冀俊忠 刘志军 刘椿年 刘红欣
• 来源期刊: 自动化学报
• 关键词: 蛋白质相互作用网络 功能模块检测 检测流程 分类体系 性能对比
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 577-593
• 页数: 17页
• 字数: 19523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1004.2014.00577

摘要

蛋白质相互作用(Protein-protein interaction, PPI)网络是生命活动中一种极其重要的生物分子关系网络,利用计算方法从PPI 网络中检测功能模块是目前生物信息学中一项重要的研究课题。本文首先总结了功能模块检测过程的基本流程,说明了预处理和后处理的作用；其次,提出了一种模块检测方法的分类体系,并对其中一些代表性的检测算法进行了阐述；再次,给出了模块检测常用的数据库、评价指标和相关软件工具,并通过实验对代表性算法进行了性能对比。最后,通过对该领域挑战性问题的分析预测了模块检测未来的研究方向,以期对相关研究提供一定的参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘椿年	北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室	81	1010	16.0	29.0
2	冀俊忠	北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室	58	626	14.0	23.0
3	刘志军	北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室	5	57	2.0	5.0
4	刘红欣	北京工业大学计算机学院多媒体与智能软件技术北京市重点实验室	1	50	1.0	1.0