安徽地方猪TLR4基因第3外显子的SNP分析

• 作者: 丁月云 孟云 张晓东 朱卫华 殷宗俊 薛玮纬 黄龙
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 安徽地方猪 TLR4基因 单核苷酸多态性 群体遗传学分析
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1767-1774
• 页数: 8页
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 4600字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.11.005

摘要

本试验采用PCR-SSCP方法对皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的遗传变异进行了检测,旨在系统分析安徽地方品种猪TLR4基因的多态性,为探讨该基因在免疫和防御系统中发挥的作用提供依据.结果检测到2个突变:G417A、C1027A,其中,G417A为非错义突变,仅在皖南黑猪、圩猪和安庆六白猪群体中检测到,且只检测到GG、GA两种基因型,在该3群体均为低度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P＞0.05);C1027A为错义突变,且引起了编码氨基酸性质的改变,在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪群体中均检测到CC、CA、AA 3种基因型,在该5群体均为中度多态,且均处于哈迪-温伯格平衡状态(P＞0.05);x2独立性检验结果表明,G417A、C1027A各基因型的分布在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个中外猪种间存在极显著差异(P＜0.01).结果提示,安徽地方猪TLR4基因外显子3区序列相对保守、多态含量较低,群体遗传变异程度较小;C1027A位点多态性在猪种间分布的差异是否与品种抗病性有关,值得进一步研究.