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摘要:
MADS-box 基因家族是植物体内的重要转录因子,它们广泛地调控着植物生长、发育和生殖等过程。本研究以蒺藜苜蓿基因组数据为材料,采用结构域搜索方法,鉴定了138个 MADS-box 基因。通过序列比对系统进化分析,将它们分成两大类:Ⅰ型(92个)和Ⅱ型(46个)。同时,通过染色体定位分析发现,134个 MADS-box 基因定位在染色体上,还有4个 MADS-box 基因定位在尚未完成最终拼接的超长片段上。蒺藜苜蓿的 MADS-box 基因家族成员之间存在大量的基因重复,特别是Ⅰ型 MADS-box 基因,通过基因复制,MADS-box 基因家族在染色体上形成多个密集的 MADS-box 基因簇。对蒺藜苜蓿的 RNA-seq 表达谱数据分析,发现 MADS-box 基因在心皮组织、花器官等组织中表达量较高,这表明蒺藜苜蓿的 MADS-box 基因家族广泛地参与苜蓿组织分化、发育以及生殖等过程的调控,这将为进一步揭示 MADS-box 类转录因子在蒺藜苜蓿中作用机制提供了重要的参考。
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文献信息
篇名 MADS-box 基因家族在蒺藜苜蓿的全基因组分析
来源期刊 草业学报 学科 农学
关键词 蒺藜苜蓿 MADS-box 系统进化分析 基因复制 表达模式
年,卷(期) 2014,(6) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 233-241
页数 9页 分类号 S816|S551+.903|Q943.2
字数 3466字 语种 中文
DOI 10.11686/cyxb20140628
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张军 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 140 320 10.0 15.0
2 宋丽莉 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 4 21 3.0 4.0
3 郭东林 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 4 48 4.0 4.0
4 郭长虹 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 4 42 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
蒺藜苜蓿
MADS-box
系统进化分析
基因复制
表达模式
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业学报
月刊
1004-5759
62-1105/S
大16开
兰州市嘉峪关西路768号(兰州市61号信箱)
54-84
1990
chi
出版文献量(篇)
4091
总下载数(次)
7
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
高等学校博士学科点专项科研基金
英文译名:
官方网址:http://std.nankai.edu.cn/kyjh-bsd/1.htm
项目类型:面上课题
学科类型:
论文1v1指导