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羊草水孔蛋白基因LcPIP的克隆与表达分析
羊草水孔蛋白基因LcPIP的克隆与表达分析
作者:
孙天旭
张旸
李玉花
汤明威
解莉楠
郭勃予
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
RACE
质膜内在蛋白
生物信息学
羊草
表达分析
摘要:
本研究基于羊草水孔蛋白EST序列,应用RACE克隆技术从盐胁迫的羊草中克隆了cDNA全长为1204 bp的水孔蛋白基因,其GenBank登录号为KJ459872。经生物信息学分析,该基因开放阅读框为879 bp,其编码的蛋白含有292个氨基酸,蛋白质分子量为30.93 kDa,理论等电点(pI)为7.00,与已知的小麦、大麦和玉米等单子叶植物来源的同类基因同源性较高,相似性为80%~98%,与小麦TaPIP1的遗传关系最近,与PIP1家族聚为一类。荧光定量PCR分析显示,在200 mmol·L-1的Na2CO3胁迫不同时间后,羊草根中LcPIP基因的表达量在6 h时受到抑制,12~24 h之间表达量明显上升,但胁迫持续48 h后, LcPIP表达量降至极低水平。羊草叶片的LcPIP基因表达量逐渐上升,48 h达到最高峰,72 h表达量下降。
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篇名
羊草水孔蛋白基因LcPIP的克隆与表达分析
来源期刊
植物生理学报
学科
关键词
RACE
质膜内在蛋白
生物信息学
羊草
表达分析
年,卷(期)
2014,(10)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1585-1592
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
五维指标
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序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李玉花
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23.0
33.0
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张旸
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解莉楠
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4
孙天旭
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郭勃予
4
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质膜内在蛋白
生物信息学
羊草
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
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植物生理学报
主办单位:
中国植物生理学会
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1108
CN:
31-2055/Q
开本:
大16开
出版地:
上海市岳阳路319号31B楼
邮发代号:
4-267
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
5646
总下载数(次)
4
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