核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析

• 作者: 刘庆忠 宗晓娟 张力思 徐丽 朱东姿 王甲威 陈新 魏海蓉
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 核桃 脱水素基因 定量RT-PCR 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1573-1582
• 分类号: S664.1
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regiaL.‘Xiangling')叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank登录号KC503061.1),其全长1 056bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素.以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4℃处理4h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能.‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低.单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697.