小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析

• 作者: 王丽侠 王素华 白鹏 程须珍 陈红霖
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 小豆 SSR标记 遗传多样性 群体结构 连锁不平衡
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 788-797
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.00788

摘要

利用57对小豆SSR标记和31对绿豆SSR标记,用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析.结果表明,共检测到630个等位变异,SSR位点等位变异数在2～17之间,遗传多样性指数范围为0.024～0.898,平均为0.574.15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,其中中国云南最高,河北和天津最低.聚类分析将254份材料划分为3个类群,在一定程度上和地理生态环境相关.LD分析显示和其他作物相比,小豆LD衰减距离较短,最大衰减距离为5.8 cM (R2＞0.1),基因组LD平均衰减距离小于1 cM (R2＞0.1,P＜0.001).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程须珍	中国农业科学院作物科学研究所	67	826	19.0	24.0
2	王丽侠	中国农业科学院作物科学研究所	46	601	16.0	23.0
3	王素华	中国农业科学院作物科学研究所	48	642	17.0	23.0
4	陈红霖	中国农业科学院作物科学研究所	8	53	5.0	7.0
5	白鹏	中国农业科学院作物科学研究所	4	45	4.0	4.0