芒果 CCR 基因的克隆及其序列分析

• 作者: 党志国 张宇 张波 罗睿雄 赵志常 陈业渊 高爱平 黄建峰
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芒果 肉桂酰辅酶A还原酶 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（z1）
• 页码范围: 16-19
• 页数: 4页
• 分类号: Q78|S667.7
• 字数: 2918字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2014.S1.004

摘要

为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因（ CCR）的全长cDNA序列，进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分析，发现芒果CCR基因包含编码区、3′和5′非翻译区的长度为1292 bp的cDNA序列，编码305个氨基酸；对跨膜结构域进行了预测，发现该基因无跨膜结构域；蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-螺旋为主；聚类分析发现，该基因与美洲山杨木、油茶等植物的亲缘关系较近，而与百合、橡胶树等亲缘关系较远。从芒果中克隆得到了一个CCR基因，并对其生物信息学进行了分析，为后续转基因工作打下了基础。