长毛对虾海水养殖环境以及虾肠道微生物群落结构研究

• 作者: 严涛 孙富林 林国荣 欧清峰 王春忠 郑志鹏 陈斌
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 长毛对虾 细菌群落 16S rRNA基因文库 海水养殖系统
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 706-712
• 分类号: Q938.1|S917.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2014.49053

摘要

为了研究长毛对虾养殖环境以及对虾肠道微生物种群结构的特征,实验分别采集养殖区进水口水体、养殖池底泥、养殖池水体以及长毛对虾肠道样品,采用构建16S rRNA基因克隆文库的方法对不同样品间的微生物群落组成进行了研究.结果表明,4组样品中共获得621条序列,操作分类单元(OTU)总数达212个,表明养殖环境微生物群落结构具有高度的多样性.从遗传进化树分析发现,进水口水体中细菌优势种群为蓝细菌(53.97％)、α-变形杆菌(13.76％)和γ-变形杆菌(10.58％);养殖池水体细菌优势种群为蓝细菌(33.55％)、γ-变形杆菌(14.84％)、厚壁菌(14.19％)、拟杆菌(12.26％)和α-变形杆菌(9.68％);养殖池底泥细菌优势种群大部分属于厚壁细菌(79.12％);对虾肠道细菌优势种群为厚壁细菌(75.79％)、梭杆菌(13.68％)和γ-变形杆菌(10.53％).在目分类水平上,养殖池底泥、养殖池水体和对虾肠道中芽孢杆菌占有较高的比例,分别占克隆数的69.78％、13.55％和72.63％;进水口水体和养殖池水体中红细菌的比例较高,分别占克隆数的10.05％和9.68％.本研究分析了养殖环境以及对虾肠道微生物的群落结构,揭示微生物从水源到对虾肠道内的演替规律.总体上,本养殖系统微生物群落结构良好,但在养殖池水体和对虾肠道中也检测到黄杆菌类群和少量的弧菌.本研究有助于了解养殖环境对于对虾肠道微生物组成的影响,并为长毛对虾病害的预防提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙富林	中国科学院南海海洋研究所	6	47	3.0	6.0
2	王春忠		15	85	5.0	8.0
3	严涛	中国科学院南海海洋研究所	39	664	14.0	25.0
4	郑志鹏		3	29	2.0	3.0
5	林国荣		37	197	9.0	12.0
6	欧清峰		1	26	1.0	1.0
7	陈斌		1	26	1.0	1.0