干旱和盐碱共胁迫下玉米EST文库的构建与分析

• 作者: 周鸣鸣 张洁 李德全 谈蓉
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 干旱 盐碱 共胁迫 EST
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 27-30
• 页数: 4页
• 分类号: S513.034
• 字数: 2645字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2014.01.005

摘要

为了构建干旱和盐碱共胁迫的玉米cDNA文库,提取YQ7-96品系的雌雄分化期(12片真叶)的混合组织(叶、茎和花芽)总RNA,运用SMART技术构建pDNR-LIB载体的cDNA文库,随机挑选克隆进行表达序列标签(EST)序列的BlastX比对和MIPS归类分析.结果表明:表达频率10的只有1个独立基因,表达频率4以上的有17个独立基因,单拷贝基因有1 693个.在基因注释中发现了4个编码早期干旱诱导蛋白质的EST,在聚类分析后得到一个片段重叠群,命名为EDIP.重叠群与玉米、水稻的早期干旱诱导蛋白质相关基因有较高的同源性,表明在干旱和盐碱共胁迫的玉米EST数据库中,高频表达的基因较少,大部分为单拷贝基因；另外,已筛选出与干旱和盐碱共胁迫相关的玉米EST.