嗜水气单胞菌转录调控蛋白基因的克隆与序列分析

• 作者: 兰云 吕爱军 朱爱华 李雪 沈晓静 胡秀彩
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 嗜水气单胞菌 转录调控蛋白 序列分析 三级结构
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 页码范围: 168-172
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

根据嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）转录调控蛋白（AhyR）基因序列设计特异性引物，采用PCR方法克隆嗜水气单胞菌Zf1菌株AhyR基因，测序目的基因大小为1063 bp。对AhyR基因编码蛋白进行生物信息学分析，推导其开放阅读框（ORF）编码260 aa，含有自体诱导物结合域（18-168 aa）、LuxR型螺旋-转角-螺旋（HTH）DNA结合结构域（176-241 aa），以及13个磷酸化位点（15S、30T、62S、144S、145S、156S、161Y、173S、184T、188T、200S、227S、231Y）。AhyR蛋白三级结构与模板（PDB：3SZT_A）相似性达28.40%，结果显示LuxR型螺旋-转角-螺旋结构域主要以α螺旋分布在C端外侧，这与拉马钱德兰图（Ramachandran plot）检测分析AhyR蛋白空间结构基本一致。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱爱华	江苏师范大学生命科学学院	18	73	5.0	8.0
2	兰云	江苏师范大学生命科学学院	8	46	4.0	6.0
3	李雪	江苏师范大学生命科学学院	15	59	5.0	7.0
4	沈晓静	江苏师范大学生命科学学院	9	53	5.0	7.0
5	吕爱军	江苏师范大学生命科学学院	17	95	7.0	9.0
6	胡秀彩	江苏师范大学生命科学学院	15	81	6.0	8.0