敦化市2009-2011年致手足口病流行肠道病毒71型基因特征分析

• 作者: 单元春 常新 曹凤瑞 王爽 田丽敏 田鑫 程涛 荆铎 魏雷雷
• 来源期刊: 疾病监测与控制
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 基因特征
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 358-359
• 分类号: R512.5
• 语种: 中文

摘要

目的 分析吉林省敦化市流行的肠道病毒71型分离株的基因特征.方法 对2009-2011年敦化市手足口病来源的3株EV71分离株进行逆转录-聚合酶链反应扩增VP1基因编码区后进行序列测定,并使用Bioedit和Maga4生物信息学软件进行基因特征分析.结果 敦化市3株EV71流行株均为C4a基因亚型,3株EV71分离株之间核苷酸同源性为98.6％～98.8％;与吉林省和龙市的流行株核苷酸同源性为98.8％～99.8％,与吉林省其他地区的2株EV71代表株的核苷酸同源性为97.6％～99.3％,与安徽省阜阳市2008年代表株的核苷酸同源性为98.3％～99.3％.敦化市3株EV71分离株之间、与2008年阜阳株以及吉林省2009-2011年3株代表株的氨基酸同源性均达到100％.结论 敦化市3株EV71分离株与同为延边州的和龙市的流行株核苷酸同源性最高,与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸也具有较近的同源性.敦化市3株EV71分离株之间以及与中国C4a基因型代表株之间都具有较高的氨基酸同源性.