基于高通量转录组测序的山羊睾丸和附睾头差异表达基因分析

• 作者: 任有蛇 张国林 张春香 赵辉 郭丽娜
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 转录组 差异表达基因 睾丸 附睾头 公山羊
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 391-401
• 页数: 11页
• 分类号: S827.2
• 字数: 7788字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.03.008

摘要

为探明山羊睾丸和附睾差异表达基因,挖掘与精子成熟和贮存密切相关的功能基因.采用Illumina HiSeqTM 2000高通量转录组测序RNA-seq技术对3只成年种公羊睾丸和附睾头进行测序,将组装得到的Unigene 比对到Nr、GO和KEGG数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析.结果显示,睾丸和附睾头Unigene总数分别为57 727个和51 395个,GO功能分类注释到生物过程、分子功能和细胞组成数据库中的分别有25 201、25 456和27 318个,其中差异表达基因数分别为9 150、9 172和10 003个;注释到KEGG通路中所有基因数23 222个,其中差异表达基因数8 219个,差异基因显著富集的信号通路:mRNA监视通路和mTOR信号通路;睾丸和附睾头中差异表达的基因共有24 592个,其中上调基因有8 420个,下调基因有16 172个.在附睾头中上调幅度最大的前3位:gDEFB124、gDEFB109和gDEFB 108,下调幅度最大的前3位:GTSF1L、SRRM1和FNDC8.附睾头中表达量最高的前3位基因依次为Lcn5、gDEFB 124和GPx5.睾丸中表达的基因数量大于附睾头中数量;β防御素家族、Lipocalin家族和GPx5可能在附睾头精子成熟、贮存和受精中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任有蛇	山西农业大学动物科技学院	150	714	13.0	18.0
2	郭丽娜	山西农业大学动物科技学院	29	200	9.0	13.0
3	张春香	山西农业大学动物科技学院	137	599	13.0	16.0
4	赵辉	山西农业大学动物科技学院	7	34	3.0	5.0
5	张国林	山西农业大学动物科技学院	10	49	4.0	6.0