东山湾青石斑鱼线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析

• 作者: 吕子君 王超 谢少林 邹记兴 陈金涛
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 青石斑鱼 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 东山湾
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 页码范围: 1270-1276
• 分类号: Q347|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2014.49270

摘要

为研究青石斑鱼种群遗传结构以实现资源保护和可持续利用,实验采用PCR技术对东山湾水域53尾青石斑鱼种群的线粒体DNA(mtDNA) D-loop区全序列进行扩增并测序,序列长度为956～1 230 bp,变异很大,这可能是由于5'端含有数目不等的重复序列单元(repeat sequence unit,RSU)或者由于碱基的插入和缺失造成的.按照RSU数目的不同,把53个青石斑鱼样本分为3大类:2RSU类(占11.3％)、3RSU类(占77.4％)、4RSU类(占11.3％).采用MEGA(version 3.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示,53条序列的T、C、A和G碱基平均含量分别为33.4％、17.3％、35.4％和13.9％,共发现53种单倍型,包括179个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.019 7,单倍型多态性(Hd)为1.000,核苷酸多态性(π)值为0.017 2.研究表明,东山湾青石斑鱼种群的遗传多样性处于中等水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹记兴	华南农业大学动物科学学院	116	496	12.0	16.0
2	王超	华南农业大学动物科学学院	52	180	8.0	10.0
3	吕子君	华南农业大学动物科学学院	19	68	5.0	7.0
4	谢少林	华南农业大学动物科学学院	32	73	5.0	6.0
5	陈金涛	华南农业大学动物科学学院	12	19	2.0	3.0