应用甜菜碱增加富含三核苷酸重复的高G-C含量DNA片段测序辨识度的最佳浓度探讨

• 作者: 余龙 王丹 蔡灏
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 关键词: 甜菜碱 三核苷酸重复 高G-C含量 DNA测序
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 163-169
• 页数: 7页
• 字数: 7914字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2014.02.008

摘要

目的 通过在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱,建立高辨识度的富含三核苷酸重复的高G-C含量DNA片段的测序体系.方法 以G-C含量为72％无三核苷酸重复的Nogo-B基因cDNA的5'端序列(the 5 ' terminal of Nago-B cDNA,Am-Nogo-B)及G-C含量为74％的富含CAG重复与CCG重复的Huntingtin基因cDNA的5'端序列(the 5'terminal of huntingtin cDNA,Am-HTT)为例,在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱,比较测序结果.结果 Am-Nogo-B与Am-HTT基因测序体系中最适宜的甜菜碱浓度相差较大.甜菜碱浓度在0.8～1.2 mol/L之间时,Am-Nogo-B测序结果质量最佳.甜菜碱浓度在1.6～2.4 mol/L之间时,Am-HTT基因的测序质量最好.结果具有良好的可重复性.结论 不同碱基组成类型的高G-C含量DNA片段,即使G-C含量接近,最适宜测序体系中甜菜碱浓度不同.探索出了适宜于增加富含三核苷酸串联重复的高G-C含量DNA片段测序辨识度的体系,可作为类似DNA片段测序的参考方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余龙	复旦大学遗传工程国家重点实验室	64	387	11.0	17.0
2	王丹	复旦大学遗传工程国家重点实验室	15	57	4.0	7.0
3	蔡灏	复旦大学遗传工程国家重点实验室	2	2	1.0	1.0