鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究

• 作者: 刘伟 刘宇 崔丽君 张桂贤 王烨 王雪娇
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: MC1R基因 系统树 分子进化 鸡形目 序列比对
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 10-16
• 页数: 7页
• 分类号: S839
• 字数: 4762字
• 语种: 中文

摘要

为了对已知的鸡形目禽类黑素皮质素受体1 (MC1R)基因进行生物信息学和分子进化分析,根据已发表的12种鸡形目物种MC1R基因序列(包括棕色来航鸡、红色原鸡、土佐本地鸡、日系乌骨鸡、白色来航鸡、日本鹌鹑、火鸡、蓝胸鹑、珠鸡、朝鲜鹌鹑、河北柴鸡和略阳乌鸡),利用多种生物学软件进行遗传多态性研究.结果显示:12种鸡形目物种MC1R基因编码区碱基序列同源性和氨基酸序列同源性均较高(分别为98.84％,98.91％),蛋白质二级结构相似度极高,以α构螺旋为主(57.32％ ～67.83％),无规则卷曲次之(25.80％ ～ 29.62％),β-折叠最少(6.05％～15.61％).红色原鸡、土佐本地鸡和棕色来航鸡的二级结构组成相同,其中红色原鸡和土佐本地鸡的碱基CDS序列完全相同.分子进化分析发现,12个鸡形目物种可以明显地分为A、B、C3个类群,火鸡、珠鸡、鹌鹑、蓝胸鹑、棕色来航鸡、红色原鸡和土佐本地鸡聚为A群;河北柴鸡、朝鲜鹌鹑和日系乌骨鸡聚为B群;白色来航鸡和略阳乌鸡聚为C群.火鸡较其他鸡形目起源较早,棕色来航鸡,白色来航鸡和略阳乌鸡起源较迟.但聚类结果中白色来航鸡和棕色来航鸡却属于不同类群,这可能是由于MC1R基因参与家禽羽色的调控,而白色来航鸡和棕色来航鸡羽毛色素存在明显差异,从而造成了二者在鸡形目MC1R基因分子进化树中的遗传距离较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张桂贤	山西农业大学动物科技学院	20	216	8.0	14.0
2	刘伟	山西农业大学动物科技学院	10	11	2.0	3.0
3	王雪娇	山西农业大学动物科技学院	4	3	1.0	1.0
4	崔丽君	山西农业大学动物科技学院	4	3	1.0	1.0
5	王烨	山西农业大学动物科技学院	4	3	1.0	1.0
6	刘宇	山西农业大学动物科技学院	5	3	1.0	1.0