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鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究
鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究
作者:
刘伟
刘宇
崔丽君
张桂贤
王烨
王雪娇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
MC1R基因
系统树
分子进化
鸡形目
序列比对
摘要:
为了对已知的鸡形目禽类黑素皮质素受体1 (MC1R)基因进行生物信息学和分子进化分析,根据已发表的12种鸡形目物种MC1R基因序列(包括棕色来航鸡、红色原鸡、土佐本地鸡、日系乌骨鸡、白色来航鸡、日本鹌鹑、火鸡、蓝胸鹑、珠鸡、朝鲜鹌鹑、河北柴鸡和略阳乌鸡),利用多种生物学软件进行遗传多态性研究.结果显示:12种鸡形目物种MC1R基因编码区碱基序列同源性和氨基酸序列同源性均较高(分别为98.84%,98.91%),蛋白质二级结构相似度极高,以α构螺旋为主(57.32% ~67.83%),无规则卷曲次之(25.80% ~ 29.62%),β-折叠最少(6.05%~15.61%).红色原鸡、土佐本地鸡和棕色来航鸡的二级结构组成相同,其中红色原鸡和土佐本地鸡的碱基CDS序列完全相同.分子进化分析发现,12个鸡形目物种可以明显地分为A、B、C3个类群,火鸡、珠鸡、鹌鹑、蓝胸鹑、棕色来航鸡、红色原鸡和土佐本地鸡聚为A群;河北柴鸡、朝鲜鹌鹑和日系乌骨鸡聚为B群;白色来航鸡和略阳乌鸡聚为C群.火鸡较其他鸡形目起源较早,棕色来航鸡,白色来航鸡和略阳乌鸡起源较迟.但聚类结果中白色来航鸡和棕色来航鸡却属于不同类群,这可能是由于MC1R基因参与家禽羽色的调控,而白色来航鸡和棕色来航鸡羽毛色素存在明显差异,从而造成了二者在鸡形目MC1R基因分子进化树中的遗传距离较远.
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内容分析
文献信息
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相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
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文献信息
篇名
鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究
来源期刊
畜牧与兽医
学科
农学
关键词
MC1R基因
系统树
分子进化
鸡形目
序列比对
年,卷(期)
2014,(7)
所属期刊栏目
试验研究
研究方向
页码范围
10-16
页数
7页
分类号
S839
字数
4762字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张桂贤
山西农业大学动物科技学院
20
216
8.0
14.0
2
刘伟
山西农业大学动物科技学院
10
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2.0
3.0
3
王雪娇
山西农业大学动物科技学院
4
3
1.0
1.0
4
崔丽君
山西农业大学动物科技学院
4
3
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1.0
5
王烨
山西农业大学动物科技学院
4
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刘宇
山西农业大学动物科技学院
5
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二级引证文献(0)
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系统树
分子进化
鸡形目
序列比对
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
畜牧与兽医
主办单位:
南京农业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-5130
CN:
32-1192/S
开本:
大16开
出版地:
南京卫岗1号南京农业大学内
邮发代号:
28-42
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
9512
总下载数(次)
18
总被引数(次)
39872
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畜牧与兽医2014年第4期
畜牧与兽医2014年第3期
畜牧与兽医2014年第2期
畜牧与兽医2014年第12期
畜牧与兽医2014年第11期
畜牧与兽医2014年第10期
畜牧与兽医2014年第1期
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