溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析

• 作者: 丁燏 吴灶和 周泽军 庞欢瑛 简纪常 黄郁葱
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 溶藻弧菌 Ⅲ型分泌系统(T3SS) 分子伴侣护航vscO基因
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 155-161
• 页数: 7页
• 字数: 4228字
• 语种: 中文

摘要

克隆了溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus）ZJ03株Ⅲ型分泌系统（T3SS）分子伴侣护航蛋白（Chaperone escort protein） vscO基因，并对其进行生物信息学分析。结果表明，vscO基因全长462 bp，编码153个氨基酸，理论分子量约为18.43 kD，pI值为9.22。细胞定位分析显示vscO基因位于外周质，不存在信号肽，无跨膜区。vscO基因具有转录起始区-35区和-10区，以及翻译识别信号SD序列（Shine-Dalgarno sequence）。该氨基酸序列含有多种活性位点，如蛋白激酶C磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌的VscO蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS的YscO蛋白有相似构型。信号通路分析推测VscO位于T3SS的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO与10种T3SS蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。