CODEHOP法设计简并引物克隆花羔红点鲑β-肌动蛋白基因及生物信息分析

• 作者: 卢玉婷 吉尚雷 张培军 张雅斌 李月红 王建超 郑伟
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 简并引物 CODEHOP β-肌动蛋白
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 10-14
• 页数: 5页
• 分类号: S961
• 字数: 3521字
• 语种: 中文

摘要

本研究克隆了花羔红点鲑β-肌动蛋白基因,结合生物信息学资源和生物软件的使用,利用CODEHOP法针对特定的氨基酸序列设计简并引物,克隆结果进行同源性分析并构建系统进化树.结果表明:应用此种方法设计出的引物简并度相对较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强;β-肌动蛋白具有高度的保守性,比对结果与虹鳟同源性达99.8％,与大马哈鱼同源性达99.3％,与大西洋鲑同源性达99.8％,系统发育关系与传统的分类相一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张雅斌		38	438	11.0	20.0
2	郑伟		44	346	9.0	17.0
3	张培军		37	77	4.0	6.0
4	李月红	吉林农业大学动物科学学院	86	353	8.0	16.0
5	卢玉婷	吉林农业大学动物科学学院	13	35	4.0	5.0
6	吉尚雷	吉林农业大学动物科学学院	9	23	3.0	4.0
7	王建超	吉林农业大学动物科学学院	7	11	2.0	2.0