玉米大斑病菌交配型基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘微微 曹志艳 董金皋 贾慧 郭丽婕 韩建民 高瑞萍
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米大斑病菌 交配型 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 10-15
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S435.131
• 字数: 4406字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2014.05.003

摘要

以真菌毒素与分子植物病理学实验室前期分离、鉴定并保存的玉米大斑病菌菌株F 1-40（A交配型菌株）、01-23（a交配型菌株）为试验材料，利用候选基因法，通过PCR扩增和Genome Walking 技术，对A交配型菌株和a 交配型菌株的MAT基因进行同源片段扩增，从而获得基因全长及其侧翼序列，进一步利用生物信息学方法对扩增得到的MAT基因全长进行保守结构域分析，利用玉米大斑病菌基因组数据库的Blast序列比对软件将MAT1基因和MAT2基因的侧翼序列进行比对。研究结果表明，在不同交配型的玉米大斑病菌中，A交配型的菌株中含有A交配型基因MAT1，a交配型菌株中含有a交配型基因MAT2。2个基因均含有1个内含子，其中MAT1基因编码包括1个完整的MAT-α结合域，该结合域属于MAT alpha1家族。 MAT2基因编码包含1个完整的HMG-box结合域，该结合域属于DNA结合蛋白中HMG-box家族的Ⅰ类成员，由3个螺旋结构组成，位于133～202个氨基酸残基之间，整体呈U型，结构比较松散，通过高度序列特异性与DNA的小沟结合，参与DNA的复制、转录、翻译等一系列的过程，从而参与玉米大斑病菌的有性生殖过程。 MAT1基因和MAT2基因侧翼序列的相似性高于93％。