黄瓜全基因组SnRK2基因的鉴定和序列特征分析

• 作者: 孙小镭 张允楠 曹齐卫 李利斌
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 黄瓜 蔗糖非发酵因子1相关蛋白激酶2 基因组分布 遗传进化 序列特征分析
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 800-807
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2014.05.0800

摘要

植物SnRK2基因在逆境应答和ABA信号转导及生长发育过程中具有重要功能.但是有关黄瓜(cucumis satovus L.)SnRK2全基因组水平的研究鲜见报道.本文利用生物信息学的方法从黄瓜基因组中鉴定出9个SnRK2基因,并对这些基因的染色体分布、内含子-外显子结构、系统进化、顺式调控元件等进行了系统分析.结果显示,黄瓜的SnRK2基因不均匀地的分布在基因组中,它们的外显子多数为9,编码区序列长度在909-1140bp之间.它们在遗传上分为3个不同的类群,预测编码的蛋白都具有激酶的典型结构.而且,在SnRK2基因上游调控序列中都含有多个不同激素和逆境应答顺式元件,预示它们在逆境应答和激素信号转导过程中具有一定功能.本文为进一步研究黄瓜SnRK2基因在逆境和激素应答中的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张允楠	山东农业大学园艺科学与工程学院	2	13	2.0	2.0