番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析

• 作者: 万红建 刘云飞 叶青静 周国治 姚祝平 李志邈 王荣青 阮美颖 韦艳萍
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 番茄 NBS-LRR CNL TNL 抗病基因
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 790-799
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2014.05.0790

摘要

NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一.番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇.利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析.随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较基因组学分析.结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5％的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系.结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的深入研究提供依据,同时也为利用番茄NBS-LRR基因进行基因定位以及相关抗病基因克隆等奠定基础.