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衣原体噬菌体Vp2蛋白的生物临床价值分析
衣原体噬菌体Vp2蛋白的生物临床价值分析
作者:
于旺
卢桂玲
姚卫锋
宋蒙蒙
李士颖
谢艳秋
原文服务方:
天津医药
微病毒属
衣原体科
细菌噬菌体
蛋白质类
计算生物学
摘要:
目的:明确衣原体噬菌体Vp2蛋白在病毒重组、筛查研究中的作用,评估Vp2的临床价值。方法以COBALT程序在线比对各株衣原体噬菌体衣壳蛋白Vp2蛋白序列;并以ProteinBlast的Distance tree功能构建种系发生树。以高保守区氨基酸序列为基础,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法分析蛋白二级结构;以Karplus-Schulz法分析柔性区域;Kyte-Doolittle法、Hopp-Woods法分析亲水性;Emini法分析表面可及性;Jameson-Wolf法分析抗原指数。结果6株衣原体噬菌体Vp2蛋白序列高度保守,差异主要在Chp1与其他5株噬菌体的Vp2蛋白之间亲缘关系较远。各株噬菌体的Vp2蛋白均有α螺旋为主的二级结构,蛋白序列高保守区存在多个细胞表位。结论 Vp2蛋白性质保守,是衣原体噬菌体衣壳的重要组分。其蛋白分子结构复杂,高保守区有较强的免疫原性,在病毒重组、沙眼衣原体噬菌体野生株筛查研究中有实际研究价值。
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文献信息
篇名
衣原体噬菌体Vp2蛋白的生物临床价值分析
来源期刊
天津医药
学科
关键词
微病毒属
衣原体科
细菌噬菌体
蛋白质类
计算生物学
年,卷(期)
2014,(7)
所属期刊栏目
细胞与分子生物学
研究方向
页码范围
634-637
页数
4页
分类号
R373.9
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.0253-9896.2014.07.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李士颖
2
15
2.0
2.0
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研究主题发展历程
节点文献
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蛋白质类
计算生物学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
天津医药
主办单位:
天津市医学科学技术信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9896
CN:
12-1116/R
开本:
大16开
出版地:
天津市和平区贵州路96号D座《天津医药》编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
9550
总下载数(次)
0
总被引数(次)
34139
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