草鱼PAX7基因的克隆、序列分析及组织表达

• 作者: 冷向军 李小勤 甘甜 胡静 郭婷 魏静
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: PAX7基因 草鱼 序列分析 组织差异表达
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 152-158
• 页数: 7页
• 语种: 中文

摘要

配对盒基因7（Paired box 7 gene，PAX7）在神经嵴发育及原肠胚形成、肌肉自主更新与再生中扮演着重要角色，对细胞更新、分化、凋亡等起着十分重要的调控作用。参照GenBank中斑马鱼、线鳍电鳗和虹鳟等物种PAX7序列的保守区域设计简并引物，进行反转录PCR扩增，获得草鱼PAX7基因的部分序列，长645 bp，编码214个氨基酸，包含编码128个氨基酸的PAX7蛋白配对框（PD）。氨基酸序列比对结果发现，草鱼PAX7基因与其他物种具有高度的相似性，与斑马鱼、线鳍电鳗、日本青鳉、金头鲷、虹鳟、大西洋鲑、北极嘉鱼、人、野牦牛、褐家鼠和小鼠的PAX7氨基酸序列同源性可达90%-97%；各物种PAX7部分氨基酸序列的系统进化树结果显示，草鱼与斑马鱼、日本青鳉、北极嘉鱼、大西洋鲑、虹鳟、线鳍电鳗和金头鲷聚为一大支，小鼠、褐家鼠，野牦牛与人类另聚一支，所得结果符合物种传统分类进化地位。运用实时荧光定量PCR检测草鱼PAX7基因在各组织中的差异表达，结果显示PAX7基因在肌肉中表达量最高；其次是前肠和皮肤，在心、脑、肾和肝中仅少量表达，所得结果与该基因的功能相一致。