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基于超高效液相色谱-质谱技术的模式识别在弥漫性轴索损伤大鼠早期血浆代谢组学中的应用
基于超高效液相色谱-质谱技术的模式识别在弥漫性轴索损伤大鼠早期血浆代谢组学中的应用
作者:
刘云志
吴涛
唐任宽
张鹏
朱士胜
朱英
李永国
李红卫
赵敏珠
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
弥漫性轴索损伤
质谱法
代谢组学
摘要:
目的 探讨基于超高效液相色谱-质谱技术(ultra performance liquid chromatographymass spectrometry,UPLC-MS)的模式识别方法应用于SD大鼠弥漫性轴索损伤(diffuse axonal injury,DAI)模型血浆代谢组学研究的可行性.方法 采用改良Marmarous法建立SD大鼠DAI模型.将18只SD大鼠按随机数字表法分为空白对照组、假手术对对照组和打击致伤组,每组6只.应用UPLC-MS技术对空白对照组、假手术对照组及打击致伤组大鼠血浆进行检测,所得数据分别采用主成分分析法(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘判别分析法(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)和正交信号偏最小二乘判别分析法(orthogonal signal correction-partial least squares discriminant analysis,OSC-PLS-DA)进行模式识别分析,确定打击致伤组与对照组血浆的代谢差异,比较三种模式识别方法的判别能力.根据PLS-DA模型的变量重要性投影(variable importance in the projection,V1P)值初步筛选出可能的代谢标志物.结果 打击致伤组与对照组血浆代谢组存在明显差异,但PCA模式识别未能将打击致伤组和对照组明显区分开,而PLS-DA和OSC-PLS-DA模式识别法可显著将其分开.初步确认7个质荷比(分别为243.102 3,227.103 0,146.165 0,59.049 7,145.1197,218.138 9,169.096 9)对应的化合物可能为大鼠DA1候选的潜在生物标志物.结论 建立了利用UPLC-MS技术进行DAI大鼠模型早期的血浆代谢组学研究检测,PLS-DA和OSC-PLS-DA模式识别法明显优于PCA模式识别法,初步筛选出大鼠DAI可能的生物标志物,为DAI早期诊断、治疗及法医学鉴定奠定了基础.
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文献信息
篇名
基于超高效液相色谱-质谱技术的模式识别在弥漫性轴索损伤大鼠早期血浆代谢组学中的应用
来源期刊
中华创伤杂志
学科
关键词
弥漫性轴索损伤
质谱法
代谢组学
年,卷(期)
2014,(11)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
1151-1155
页数
5页
分类号
字数
3832字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1001-8050.2014.11.024
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质谱法
代谢组学
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研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华创伤杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-8050
CN:
50-1098/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市渝中区大坪长江支路10号
邮发代号:
78-83
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7393
总下载数(次)
12
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