辣椒WRKY转录因子的鉴别及进化分析

• 作者: 刁卫平 刘金兵 戈伟 潘宝贵 王述彬 郭广君
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 WRKY 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 45-51
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S641.03
• 字数: 3392字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2014.06.009

摘要

为了深入了解WRKY转录因子调节植物生长发育的过程,以辣椒全基因组和辣椒疫病转录组测序数据为材料,利用生物信息学方法分析辣椒WRKY转录因子的数目、种类、系统发生学和保守基序特征。结果表明,辣椒基因组中至少存在40个WRKY基因,包含1~2个WRKY保守结构域,根据WRKY结构域的数量及锌指结构的特征可将其分为Ⅰ、Ⅱ( a)、Ⅱ( b)、Ⅱ( c)、Ⅱ( d)、Ⅱ( e)和Ⅲ类/亚类。辣椒WRKY基因的保守motif共有3个,motif长度最长为50,最短为21,辣椒WRKY编码的蛋白为151~747个氨基酸,平均氨基酸数量为378.1个。该研究对辣椒WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王述彬	江苏省农业科学院蔬菜研究所	99	728	13.0	22.0
2	刁卫平	江苏省农业科学院蔬菜研究所	35	144	7.0	10.0
3	刘金兵	江苏省农业科学院蔬菜研究所	85	622	13.0	21.0
4	潘宝贵	江苏省农业科学院蔬菜研究所	81	546	13.0	19.0
5	戈伟	江苏省农业科学院蔬菜研究所	33	130	7.0	9.0
6	郭广君	江苏省农业科学院蔬菜研究所	14	57	5.0	7.0