基于454测序的碧桃花瓣组织转录组核苷酸变异1）

• 作者: 刘海琳 戴晓港 李淑娴 陈赢男 马秋月
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 碧桃 转录组测序 单核苷酸多态性 插入缺失长度多态性
• 年，卷（期）: 2014,（12）
• 页码范围: 85-88
• 页数: 4页
• 分类号: S662.1
• 语种: 中文

摘要

通过对碧桃花瓣组织进行转录组测序，获得1556684条序列，平均读长446 bp，共计695．34 Mb数据，其中1492289条高质量序列经拼接后得到22762个重叠群。以拼接后的重叠群作为参考序列，利用SNP／InDel分析软件检测碧桃花瓣组织转录组中的核苷酸变异位点，共得到9836个SNP和1550个InDel位点。在SNP位点中，转换占62．55％、颠换占37．45％，A／G的变异最为丰富，C／G的变异最少。在InDel位点中，有34．71％的位点为单核苷酸插入、缺失突变。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴晓港		17	162	8.0	12.0
2	李淑娴		51	641	14.0	23.0
3	陈赢男		15	104	7.0	10.0
4	马秋月		9	222	6.0	9.0
5	刘海琳		3	12	2.0	3.0