两个苹果RNA解旋酶基因的基本特征与表达分析

• 作者: 刘慧莲 张世忠 曹慧 王建波 许瑞瑞
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 RNA解旋酶 基因特征 启动子序列分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 91-96
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学方法对2个苹果RNA解旋酶基因染色体定位、系统进化关系和氨基酸序列基本特征等进行了预测,分析了基因在果实成熟期和砧穗互作中的表达差异;利用PlantCARE软件对二者的启动子序列中所包含的响应元件进行了预测和分析;利用qRT-PCR方法分析了2个苹果RNA解旋酶基因的组织表达模式.结果表明:“金冠”苹果基因组中鉴定了2个RNA解旋酶基因,命名为Mdhelicase1、Mdhelicase2,分别分布在苹果第6、17条染色体上;表达谱芯片分析发现,在苹果果实成熟时期和砧木接穗互作过程中,Mdhelicase1和Mdhelicase2基因的表达有不同程度的变化;2个基因的启动子区域存在多个胁迫响应元件,如MBS、HSEs、TCrich repent、AREs、ABREs、GARE motif、P box、CGTCA motif、TGACE motif、Light responsive elemonts等.Mdhelicase1、Mdhelicase2在“平邑甜茶”茎、叶、花、果实中都有表达,二者分别在茎和叶中的表达量最高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹慧	潍坊学院山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室	65	522	12.0	20.0
2	刘慧莲	潍坊学院山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室	25	81	6.0	7.0
3	许瑞瑞	潍坊学院山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室	12	83	4.0	9.0
4	张世忠	山东农业大学国家苹果工程技术研究中心	8	76	4.0	8.0
5	王建波	潍坊学院山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室	6	46	3.0	6.0