陆川猪脂蛋白脂酶基因的克隆与序列分析

• 作者: 何少婧 兰干球 李莉 梁明振 蒋钦杨 韦玲静 黄艳娜
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 陆川猪 脂蛋白脂酶基因 克隆 序列分析 同源性 蛋白二级结构
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1074-1078
• 页数: 5页
• 分类号: S828.89
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.6.1074

摘要

[目的]对陆川猪脂蛋白脂酶(LPL)基因进行克隆与序列分析,为后期开展LPL基因表达与陆川猪肌内脂肪沉积的相关性研究奠定基础.[方法]根据GenBank中已公布的猪LPL基因序列设计引物,以陆川猪背最长肌组织总RNA为模板,利用RT-PCR扩增其LPL基因,测序结果用Lasergene 7.0软件进行序列分析,用MEGA 6.0软件进行同源性比较及构建系统进化树,同时利用在线蛋白质结构分析软件(PMP)预测陆川猪LPL蛋白二级结构.[结果]成功克隆获得陆川猪LPL基因编码区长1437 bp,与GenBank中已公布普通猪、大白猪、杜洛克猪、通城猪、贵州白香猪的基因同源性分别为99.6％、99.7％、99.7％、99.7％和99.4％.陆川猪LPL基因第760位点存在特有的碱基A,该突变导致缬氨酸突变为蛋氨酸.由基于LPL基因碱基同源性构建的物种系统进化树可知,广西陆川猪与大白猪的遗传距离最近,其次是山羊,最远的是小鼠.蛋白二级结构预测结果表明,陆川猪的LPL蛋白二级结构包含有N-端结构域和C-端结构域两个区域,且存在PLAT/LH2.[结论]LPL基因可作为研究陆川猪脂肪沉积的主要候选基因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄艳娜	广西大学动物科学技术学院	31	58	5.0	6.0
2	蒋钦杨	广西大学动物科学技术学院	97	256	8.0	12.0
3	李莉	广西大学动物科学技术学院	37	145	9.0	11.0
4	梁明振	广西大学动物科学技术学院	99	715	14.0	21.0
5	兰干球	广西大学动物科学技术学院	92	263	7.0	12.0
6	何少婧	广西大学动物科学技术学院	2	3	1.0	1.0
7	韦玲静	广西大学动物科学技术学院	8	11	2.0	3.0