靶向转化生长因子-βⅡ型受体核酸适配子结合位点预测及相关验证研究

• 作者: 朱晓燕 王薇 肖奕 许多 谢琳 陈侠 黄阳玉
• 来源期刊: 重庆医学
• 关键词: 转化生长因子-βⅡ 寡核苷酸类 分子对接 结合位点 生物传感器
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 1034-1037
• 页数: 4页
• 字数: 4913字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2014.09.004

摘要

目的：预测转化生长因子-βⅡ型受体（T RβⅡ）胞外段蛋白与靶向适配子S58的结合位点，并在体外进行验证，证实S58的结构稳定性。方法通过适配子ssDNA序列建立其三维结构，在蛋白质数据库搜索受体蛋白 TRβⅡ胞外段的晶体结构，运用计算机辅助技术对两个分子进行对接实验，根据结果指导剪切优化适配子结构，分别用生物传感器技术及蛋白免疫印迹法验证其亲和力。结果核酸适配子ssDNA S58与 TRβⅡ胞外段蛋白结合的可信位点包括位点Ⅰ（T4、T5、G6、C7）、位点Ⅱ（G13、A14、T15、C16、G17、C18）、位点Ⅲ（T31、G32、T33、C34）及位点Ⅳ（G40、A41、T42、T43、T44、G45、G46）。S58与TRβⅡ胞外段蛋白的亲和力高，S58的α-平滑肌肌动蛋白（α-SMA）表达明显较DMEM 对照降低（P＜0．05），根据结果剪切适配子S58后得到优化后的ssDNA亲和力、α-SMA表达均不如S58。结论核酸适配子S58为受体蛋白TβRⅡ的高特异性分子，具有一定稳定性，任何结构的改变均会降低与TβRⅡ的亲和力。计算机辅助的分子对接技术成为一项探索分子间作用的重要手段，为医学基础研究提供了良好的理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖奕	华中科技大学物理学院	16	36	3.0	5.0
2	谢琳	第三军医大学大坪医院野战外科研究所眼科	28	154	6.0	11.0
3	许多	第三军医大学大坪医院野战外科研究所眼科	9	29	4.0	5.0
4	王薇	第三军医大学大坪医院野战外科研究所眼科	4	6	2.0	2.0
5	黄阳玉	华中科技大学物理学院	1	0	0.0	0.0
6	朱晓燕	第三军医大学大坪医院野战外科研究所眼科	7	23	3.0	4.0
7	陈侠	第三军医大学大坪医院野战外科研究所眼科	5	10	3.0	3.0