低温处理与常温凡纳滨对虾基因差异表达文库的构建及分析

• 作者: 彭金霞 蒋小珍 陈晓汉 韦嫔媛
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 凡纳滨对虾 抑制性消减杂交技术(SSH) 文库 耐寒相关基因 斑点杂交
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1662-1668
• 页数: 7页
• 分类号: S945.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2014.9.1662

摘要

[目的]筛选出对虾耐寒相关基因,为今后进一步研究对虾耐寒分子机理提供科学依据.[方法]利用SSH技术构建低温处理与常温凡纳滨对虾的基因差异表达文库,并通过斑点杂交、克隆测序分析及候选基因RT-PCR扩增等对差减获得的耐寒相关功能基因进行验证.[结果]在构建的正、负文库768个克隆中有152个为低温高表达克隆、331个为常温高表达克隆;将正文库100个克隆拼接可获得ESTs同源群39个,其中已知基因29个,主要涉及能量代谢、表达调控、信号传导、细胞免疫、抗细胞凋零、蛋白质加工及其他基因等;将负文库50个克隆拼接可获得ESTs同源群18个,其中已知基因17个,主要涉及细胞免疫、维持细胞代谢、物质转运、信号传导及其他基因等.经RT-PCR验证,从正文库中筛选出的HSPB1、NGT4和NGT7基因在低温条件下的表达量显著高于常温.[结论]综合运用SSH、斑点杂交、克隆测序和RT-PCR可有效筛选并验证凡纳滨对虾耐寒相关基因,为揭示对虾耐寒分子调控机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋小珍	广西大学动物科学与技术学院	3	9	2.0	3.0