盐藻DsMAPKKK基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘世才 柴晓杰 王逸云 郭卫华 韩冬梅
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 盐藻 MAPKK激酶(MAPKKK) 全长cDNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术—研究报告
• 页码范围: 274-281
• 分类号: Q78
• 语种: 中文

摘要

为了阐明MAPKs级联反应在盐藻耐盐机制中发挥的作用,需要克隆MAPKs信号转导途径中的成员之一MAPKKK基因并研究其功能.采用RT-PCR与RACE技术从盐藻中首次克隆到一个盐藻MAPKK激酶基因,将其命名为DsMAPKKK (GenBank Accession No.KF366904)并进行了生物信息学分析.结果表明,DsMAPKKK基因的cDNA全长为1460 bp,开放阅读框为879 bp,编码292个氨基酸;该蛋白无信号肽,无跨膜域,是定位于细胞质基质的亲水性不稳定蛋白质;蛋白质序列中包含一个24-45位的蛋白激酶ATP结合区和一个137-149位的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区;发现了多个潜在的磷酸化位点和一个重要的催化活性位点Asp141;蛋白质二级结构的主要组成元件为α-螺旋和自由卷曲;成功构建了蛋白质三级结构立体模型;系统进化分析表明该蛋白质与团藻、衣藻的相应蛋白进化关系最近.