枣转录因子ERF 3'端序列克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘孟军 苑赞 赵锦 陈莹莹
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 枣 ZjERF 3’端序列克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（22）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 93-97
• 分类号: Q785|S665
• 语种: 中文

摘要

以枣为试材,根据GenBank中登录的苹果、拟南芥等植物EFR保守序列设计引物,采用同源克隆法克隆出该基因3 '端序列并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析.结果表明:该试验克隆获得1条长度为959 bp的条带;经过序列分析,该序列包含典型的AP2/EREBP保守结构域,与桑树、欧洲山毛榉和欧洲栗ERF基因序列相似度分别为79％、78％、77％;系统进化树分析显示,枣的ZjERF与可可树、陆地棉和海岛棉的AP2/ EREBP亲缘关系较近,属于ERF家族的B2亚群;此外,还用Swiss Model程序(http://au.expasy.org/tools/)预测了ZjERF基因编码蛋白的三维结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵锦	河北农业大学生命科学学院	80	1277	21.0	32.0
2	刘孟军	河北农业大学中国枣研究中心	195	3609	34.0	49.0
3	陈莹莹	河北农业大学中国枣研究中心	9	25	4.0	4.0
4	苑赞	河北农业大学中国枣研究中心	2	21	1.0	2.0