猪全基因组中微卫星分布规律

• 作者: 戚文华 肖国生 蒋雪梅 黄小云
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 基因组 微卫星序列 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 9-13
• 页数: 5页
• 分类号: S828
• 字数: 3261字
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学方法搜索猪全基因组中完整型微卫星序列,并对其基因组中微卫星数量、频率以及分布规律进行了研究.搜索到猪全基因组中1～6个碱基重复类型微卫星位点数为1 149 884个,占其全基因组长度的比率为0.85％,出现频率为1/2.22 kb.猪第1条染色体(143 330个)中微卫星数量最多,其次是第2、6和13条染色体,而较少的是第12、18条染色体和Y染色体.猪性染色体X和Y序列长度差异极显著,X染色体序列长度是Y染色体的88.10倍,其微卫星数量也存在明显差异(58 437 w 814).通过检验表明,猪染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性(r=0.913,P＜0.01).猪全基因组中完整型微卫星各重复类型中,单碱基重复类型数量最多,占其微卫星总数量的比率为62.95％;其次依次是二碱基、四碱基、三碱基、五碱基、六碱基重复类型.猪全基因组中微卫星重复拷贝类别数量较多的是A、AC、AT、AAC、AAT、AAATAAAC、AAAG、AAGG,而数量较少的是C、CG、AGC、AGT、ACT、AGCG、AGTC、ACTG和CCGG.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄小云	重庆三峡学院生命科学与工程学院	36	223	8.0	13.0
2	肖国生	重庆三峡学院生命科学与工程学院	69	215	8.0	11.0
3	蒋雪梅	重庆三峡学院化学与环境工程学院	19	72	5.0	8.0
4	戚文华	重庆三峡学院生命科学与工程学院	25	109	6.0	9.0