西洋参PqGA2ox基因的克隆与序列分析

• 作者: 孙同玉 孙鹏 廖登群 李先恩 祁建军 祝娟
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 西洋参 种子休眠 萌发 赤霉素2-氧化酶 克隆 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2014,（24）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3599-3606
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.24.019

摘要

目的 克隆、分析西洋参Panax quinquefolium种子萌发过程的赤霉素2-氧化酶(gibberellin 2-oxidase,GA2ox)基因.方法 从前期由高通量测序得到78 207条unigenes基因的注释信息中挖掘出与赤霉素合成和分解代谢相关的基因序列,得到11条GA2ox基因相关序列,通过序列比对分析确定GA2ox的转录本.根据选定的unigene序列设计引物,采用PCR方法扩增西洋参GA2ox的cDNA全长;利用生物信息学方法分析所得基因,并用实时荧光定量PCR技术进行表达分析.结果 得到一条长度为987 bp,编码328个氨基酸残基的西洋参GA2ox基因,命名为PqGA2ox.生物信息学预测PqGA2ox蛋白不含跨膜区,不含信号肽,具有依赖于2-酮戊二酸和Fe2+的双加氧酶超家族的保守结构域.实时荧光定量PCR结果显示在形态休眠中期和生理休眠中期的表达量低于其休眠起始期和解除休眠期.结论 首次获得西洋参种子PqGA2ox基因的编码区序列,为进一步研究西洋参种子解除休眠的分子机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	祁建军	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	59	458	12.0	19.0
2	李先恩	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	110	1048	17.0	27.0
3	孙鹏	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	30	233	9.0	14.0
4	廖登群	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	9	39	4.0	6.0
5	孙同玉	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	3	26	3.0	3.0
6	祝娟	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	2	8	2.0	2.0