不同居群草珊瑚的ITS序列分析及模式识别研究

• 作者: 杨群雄 梁一池 牛广俊 罗林泉 陈艺娟 陈莹 魏艺聪
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 草珊瑚 金粟兰 ITS序列 品种鉴别 聚类分析
• 年，卷（期）: 2014,（20）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2982-2986
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.20.021

摘要

目的 通过分析不同居群草珊瑚Sarcandra glabra和金粟兰属5种近缘植物的核糖体基因内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,为草珊瑚鉴定和品种鉴别提供模式识别与思路.方法 采集不同产地的草珊瑚18份、金粟兰6份,所有样品提取总DNA,并对其ITS片段进行扩增、测序,并搜索GenBank数据库中收录的其他4种金粟兰属植物的ITS序列,运用ClustalX 2.1软件比较不同产地草珊瑚与其他金粟兰属植物的ITS序列差异,并对其进行聚类分析.结果 草珊瑚样品不同居群间的ITS序列相似度达99％,其中位点总突变率ITS1(2.7％)＞ITS2(1.4％),而与金粟兰属其他植物相比,位点总突变率ITS2 (20.3％～22.7％) ＞ITS1 (15.9％～18.3％).聚类分析表明18个不同种群的草珊瑚居群间变异极小,且与金粟兰属5种近缘植物具有显著差异的聚类识别.结论 草珊瑚ITS1与ITS2分别为不同居群间及与不同属近缘植物间比较有效的鉴别序列,具有较多个特异性信息位点的草珊瑚ITS序列用于鉴别金粟兰属5种近缘植物,具显著差异的聚类识别,是草珊瑚和金粟兰属近缘植物鉴定和品种鉴别的有效分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁一池	福建中医药大学药学院	58	327	10.0	14.0
2	陈莹	福建农林大学园林学院	34	129	7.0	9.0
3	牛广俊	福建中医药大学药学院	11	69	5.0	8.0
4	魏艺聪	福建中医药大学药学院	24	97	6.0	8.0
5	罗林泉	福建中医药大学药学院	4	17	3.0	4.0
6	杨群雄	福建中医药大学药学院	4	17	3.0	4.0
7	陈艺娟	福建中医药大学药学院	4	17	3.0	4.0