基于Diurnal在线软件分析拟南芥生物节律基因对GABA的响应

• 作者: 余光辉 向文豪 崔国鹏 王圣洁 龚汉雨
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: Diurnal软件 生物钟 基因表达 γ-氨基丁酸 拟南芥
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 基础性研究与方法
• 页码范围: 24-27,45
• 页数: 5页
• 分类号: Q94
• 字数: 3576字
• 语种: 中文

摘要

Diurnal是一个基于网络的在线分析工具，利用该工具可以得到几种模式植物基因组范围内的昼夜和生物钟节律基因表达的变化规律。这一在线分析软件是一个可供搜索的数据库，它提供了几个基于网络的界面友好的数据挖掘工具，其结果以一种易于理解的方式呈现。在该研究中首先介绍了这个在线软件的使用方法，然后分析了几个拟南芥生物钟节律基因和开花基因在长日照条件下的表达模型，这些结果可以以图形和数字的方式下载用于后续的特定研究。结合在线数据，该研究表明，γ-氨基丁酸（GABA在1.0mmol/L）可以改变3个生物钟核心节律基因（TOC1，CCA1和LHY）的表达模式，这种模式的改变主要是增加了这些基因表达的幅度。