一种新的D NA序列图形表达的方法

• 作者: 年晓红 胡扬
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: DNA序列图形表达 DNA序列比较 代谢编码 Metabolism图形表达 人工代谢系统
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 页码范围: 3221-3224
• 页数: 4页
• 分类号: TP182
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2014.11.005

摘要

针对当前DNA序列图形表达模式中存在简并现象的相关问题，提出了一种新的二元符号图形表达方式。将四类碱基的编码过程看成是构成DNA序列的元素在直角坐标平面上的移动过程，以两种不同的标志符号来解决可能出现的元素重叠情况。此方案所标志的图形不存在自交现象，从而在DNA序列和图形表达之间建立了一一对应的关系。通过实例说明该方法在对无向图和有向图表达中均能有效地降低图形简并度，并引入人工代谢系统中的编码模式作为分析工具对DNA序列进行比较分析；以代谢中间物值作为参数，研究不同物种的DNA序列之间的相似性。实例分析表明，该参数能较好地表征不同物种之间的相似性程度高低，是一种简便可行的DNA序列特征的比较方法。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡扬	中南大学信息科学与工程学院	25	49	3.0	4.0
2	年晓红	中南大学信息科学与工程学院	103	1041	17.0	25.0