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基于生物信息学方法筛选卵巢癌铂类化疗耐药相关基因的研究
基于生物信息学方法筛选卵巢癌铂类化疗耐药相关基因的研究
作者:
张明铭
徐红
林丽娜
韦仕洋
黄晶
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
卵巢癌
化学治疗
耐药
基因
生物信息学
摘要:
目的:从分子水平揭示卵巢癌化疗耐药的发病机制,为进一步的临床研究提供参考。方法在公共基因芯片数据库GEO中找到卵巢癌相关基因芯片数据,使用Bioconductor R 2.13.0软件包对其进行分析,找到卵巢癌化疗铂类化疗耐药相关基因;利用STRING 9.1、DAVID 6.7在线工具对这些基因进行生物学分析。结果共获得283个差异表达基因,其中表达上调基因69个,下调表达基因214个。62个基因的蛋白有相互关系,确定ESR1、IGF1、SDC2、ADCY2、ADCY8、PTHLH、BMP等为关键基因。这些基因的功能主要涉及底物特异性通道活性、被动的跨膜转运活性,参与钙信号通路、MAPK 信号通路等。结论利用生物信息学的方法分析基因芯片数据可有效筛选并确定其中的关键基因,卵巢癌铂类化疗耐药的发生与基因分子水平表达变化有关,确定复发性卵巢癌相关基因的功能及其参与通路为研究卵巢癌耐药的治疗靶点提供了新的思路。
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文献信息
篇名
基于生物信息学方法筛选卵巢癌铂类化疗耐药相关基因的研究
来源期刊
广西医学
学科
医学
关键词
卵巢癌
化学治疗
耐药
基因
生物信息学
年,卷(期)
2014,(12)
所属期刊栏目
论著? 基础研究
研究方向
页码范围
1692-1694
页数
3页
分类号
R737.31
字数
2618字
语种
中文
DOI
10.11675/j.issn.0253-4304.2014.12.04
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
徐红
广西医科大学第一附属医院妇科
99
485
11.0
17.0
2
黄晶
10
34
3.0
5.0
3
张明铭
8
30
3.0
5.0
4
韦仕洋
广西医科大学第一附属医院妇科
2
12
1.0
2.0
5
林丽娜
广西医科大学第一附属医院妇科
2
12
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参考文献(1)
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参考文献(1)
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2014(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2014(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
卵巢癌
化学治疗
耐药
基因
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西医学
主办单位:
广西壮族自治区医学情报研究所
出版周期:
半月刊
ISSN:
0253-4304
CN:
45-1122/R
开本:
大16开
出版地:
广西南宁市东葛路20-7号
邮发代号:
48-29
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
22057
总下载数(次)
12
总被引数(次)
72096
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