新疆雪莲rbcs基因的克隆及序列分析

• 作者: 张亚敏 李曹龙 杨晶 王爱英 祝建波
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 新疆雪莲 克隆 序列分析 rbcs
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术—研究报告
• 页码范围: 261-267
• 分类号: Q78
• 语种: 中文

摘要

为获得新疆雪莲Rubisco(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶)小亚基基因,并对其序列进行生物信息学分析;从已建立的新疆雪莲cDNA文库中,随机挑取单克隆,采用通用引物M13扩增并测序,测序结果在NCBI网址进行Blast比对,结果发现了2个与rbcs基因同源的序列并命名为sikrbcs1和sikrbcs2;生物信息学分析表明:sikrbcs1基因包含1个540 bp的完整开放阅读框,编码179个氨基酸,sikrbcs2基因包含1个420 bp的完整开放阅读框,编码139个氨基酸.sikrbcs1基因编码的蛋白质的理论等电点是8.90,分子量为20.1042 kD,具有2个跨膜区域,sikrbcs2基因编码的蛋白质理论等电点是7.58,分子量为15.1093 kD,不具有跨膜区域.氨基酸多序列比对表明,Sikrbcs1与黄顶菊和向日葵的相似性最高,达到83.89％,Sikrbcs2与向日葵的相似性最高达到57.54％;系统进化树显示表明,sikrbcs1和sikrbcs2都与菊花亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	祝建波	新疆石河子大学生命科学学院	10	42	4.0	6.0
2	王爱英	新疆石河子大学生命科学学院	17	49	4.0	5.0
3	杨晶	新疆石河子大学生命科学学院	7	25	3.0	4.0
4	张亚敏	新疆石河子大学生命科学学院	2	10	1.0	2.0
5	李曹龙	新疆石河子大学生命科学学院	5	26	4.0	5.0