基于nrDNA-ITS序列的10种枸杞属植物亲缘关系研究

• 作者: 何丽娟 张晓娜 李小刚 李捷 王有科 葛晶
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 枸杞属 ITS序列 测序 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2014,（25）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 128-135
• 分类号: Q111.9
• 语种: 中文

摘要

以10种枸杞属植物为材料,利用nrDNA-ITS序列,探讨其遗传多样性及亲缘关系.采用改进CTAB法提取枸杞叶片基因组DNA,利用合成的ITS4和ITS5为引物对其DNA中的nrDNA-ITS区进行扩增、对目的片段测序,并对测序结果进行聚类分析.测序结果表明,10种枸杞属植物ITS的长度为582～656 bp,保守位点(C)560个,变异位点(V)95个,其中简约信息位点(Pi)70个,单核苷酸变异位点(S)25个;5.8S序列的长度均为154bp,保守位点(C)136个,变异位点(V)18个,其中简约信息位点(Pi) 12个,单核苷酸变异位点(S)6个.10条序列聚类图明显地分为2大类5个小组,‘0901’与‘蒙杞1号’处于同一分支,亲缘关系最近,‘宁杞3号’和‘宁杞7号’为同一分支,亲缘关系最近,‘宁杞5号’和青海诺木洪黑果枸杞单独为一分支,与其他几个枸杞品种的亲缘关系最远.10条枸杞属植物的ITS序列已上传至NCBI,登录号为J189761～KJ189770.本研究测序和分析了10种枸杞属植物的ITS序列,聚类结果表明了它们之间的亲缘关系与差异,为枸杞遗传多样性和系统发育研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李小刚	甘肃农业大学林学院	23	624	12.0	23.0
2	李捷	甘肃农业大学林学院	29	240	8.0	14.0
3	王有科	甘肃农业大学林学院	57	571	14.0	21.0
4	张晓娜	甘肃农业大学林学院	5	19	3.0	4.0
5	葛晶	甘肃农业大学林学院	4	11	2.0	3.0
6	何丽娟	甘肃农业大学林学院	2	0	0.0	0.0