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桑氧化固醇结合相关蛋白的基因克隆及序列与表达分析
桑氧化固醇结合相关蛋白的基因克隆及序列与表达分析
作者:
刘利
叶楚华
尚亚君
师彗云
王恒
胡兴明
赵卫国
邓文
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
桑树(Morus L.)
氧化固醇结合蛋白相关蛋白
基因克隆
序列特征
基因表达
摘要:
氧化固醇结合蛋白家族是一类存在于真核生物中的能结合氧化固醇的保守蛋白,主要作用是参与细胞中的脂类代谢、囊泡运输及信号转导等方面.试验利用RT-PCR和RACE技术从桑树(MorusL.)鲁桑系品种育71-1(M.multicaulis Perr.cv.Yu 71-1)中克隆出一个氧化固醇结合蛋白相关蛋白基因,该cDNA全长1 974 bp,含有一个完整的全长1 371 bp的读码框(ORF),内有220 bp的5'非翻译区(5'UTR)和383 bp的3'非翻译区(3'UTR),3'端以Poly (A)15结束.其开放读码框共编码456个氨基酸,分子量为51.97 kD,等电点为5.143.利用Pfam和PROSITE在线分别进行了蛋白质的结构及功能位点和motif预测,结果显示,该蛋白为氧化固醇结合蛋白相关蛋白家族的成员,具有氧化固醇结合蛋白相关结构域,且含有该家族蛋白特有的极其保守的指纹基序“EQVSHHPP”.多重序列比对结果表明,该蛋白高度保守,在系统进化树中桑树与野草莓(Fragaria vesca subsp.vesca L.)、碧桃(Prunus persica Batsch.var.duplex Rehd.)等的亲缘关系较近.Real-time PCR分析表明,该基因在花、幼果、成熟果的表达量比根、茎和芽中的表达量要高.在高盐胁迫下,桑树Ma-acyin-ORP基因的表达量先升高、后下降,初步推断该基因可能参与某种压力胁迫的生理反应.
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内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
桑氧化固醇结合相关蛋白的基因克隆及序列与表达分析
来源期刊
湖北农业科学
学科
农学
关键词
桑树(Morus L.)
氧化固醇结合蛋白相关蛋白
基因克隆
序列特征
基因表达
年,卷(期)
2014,(24)
所属期刊栏目
园艺·特产
研究方向
页码范围
6030-6037
页数
8页
分类号
S888.2|S813.3|Q785
字数
6186字
语种
中文
DOI
10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2014.24.034
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
胡兴明
湖北省农业科学院经济作物研究所
84
276
9.0
11.0
2
邓文
湖北省农业科学院经济作物研究所
57
190
8.0
10.0
3
赵卫国
江苏科技大学生物技术学院
27
192
8.0
13.0
4
刘利
江苏科技大学生物技术学院
23
185
8.0
13.0
5
尚亚君
江苏科技大学生物技术学院
2
0
0.0
0.0
6
王恒
江苏科技大学生物技术学院
3
0
0.0
0.0
7
师彗云
湖北省农业科学院经济作物研究所
2
0
0.0
0.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(37)
共引文献
(6)
参考文献
(18)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1984(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1985(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1989(6)
参考文献(0)
二级参考文献(6)
1990(3)
参考文献(0)
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1992(2)
参考文献(0)
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1994(2)
参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(1)
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1997(2)
参考文献(1)
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参考文献(2)
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2014(0)
参考文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
桑树(Morus L.)
氧化固醇结合蛋白相关蛋白
基因克隆
序列特征
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
湖北农业科学
主办单位:
湖北省农业科学院
华中农业大学
长江大学
黄冈师范学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0439-8114
CN:
42-1255/S
开本:
大16开
出版地:
武汉市武昌南湖瑶苑2号
邮发代号:
38-21
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
19680
总下载数(次)
22
总被引数(次)
84101
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