甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探

• 作者: 卢浩 张自强 李冠 杨雅婷 王贤磊 高兴旺
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 甜瓜 基因组 SSR 分布 多态性
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 93-97
• 分类号: S652
• 语种: 中文

摘要

以3个甜瓜品种“BM7”、“伽师瓜”和“Y8”为试材,选取甜瓜基因组的3个DNA区域进行SSR位点的分布规律分析,进一步通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检验甜瓜基因组SSR位点的多态性,以期初步揭示甜瓜基因组中SSR位点的分布规律及其多态性,进而为甜瓜及其它物种开展相关研究提供参考.试验表明:甜瓜基因组中平均每1.9 kb就有一个SSR位点,富含A和T的重复基序出现的频率远高于富含C和G的重复基序的频率,没有发现全部由C、G构成的重复基序;二、三、四碱基重复基序的SSR位点占绝大多数(83.3％),五、六碱基重复基序的SSR位点分布较少(16.7％).二、三、四、五、六核苷酸重复基序SSR位点平均长度依次为21、15、14、16、20 bp.设计的82对SSR引物中81对扩增出产物,多态比例最高为48.1％.试验表明,甜瓜基因组中SSR分布具有一定规律,并且可以利用SSR分子标记开展相关研究;试验同时对更好地开展SSR和ISSR分子标记的相关研究奠定了理论基础和依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李冠	新疆大学生命科学与技术学院	125	1244	20.0	27.0
2	王贤磊	新疆大学生命科学与技术学院	35	306	9.0	16.0
3	高兴旺	新疆大学资源与环境科学学院	17	115	6.0	10.0
4	张自强	新疆大学资源与环境科学学院	3	17	2.0	3.0
5	杨雅婷	新疆大学生命科学与技术学院	4	8	2.0	2.0
6	卢浩	新疆大学生命科学与技术学院	5	24	3.0	4.0