辣椒疫霉 NPP 效应子基因家族生物信息学分析

• 作者: 冯宝珍 刘缙 成娟丽 李培谦
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒疫霉 NPP基因家族 效应子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 28-31,32
• 页数: 5页
• 分类号: S436.418.1+9
• 字数: 3220字
• 语种: 中文

摘要

NPP（ necrosis-inducing Phytophthora protein）是一类效应子，在卵菌疫霉属病原菌中普遍存在，该类蛋白能够激发植物的防御反应，如引起植物细胞死亡、促使寄主防御基因表达及产生乙烯。利用生物信息学方法对辣椒疫霉（ Phytophthora capsici）基因组内的NPP基因家族存在状况进行分析，并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质三级结构等进行预测分析，旨在了解其结构特征，进而发掘辣椒疫霉的致病相关基因。结果表明：NPP基因家族有25个成员，其中大部分成员存在多个拷贝。对25个NPP氨基酸序列进行分析发现，其分子量在12．45～88．9 ku之间；对其中15个NPP蛋白进行三级结构预测发现，它们的三维结构类似，其主要的结构元件为α-螺旋和β-片层；构建了25个NPP蛋白的进化树，进行了分子进化分析。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘缙		7	5	1.0	1.0
2	冯宝珍		11	19	3.0	4.0
3	成娟丽		2	1	1.0	1.0
4	李培谦		10	16	3.0	3.0