差异蛋白基因生物信息学在冠心病血瘀证遗传相关验证中的应用

• 作者: 刘吉勇 孙贵香 宁桂兰 张敏州 李杰 王丽萍 简维雄 袁肇凯 郑景辉 黄献平
• 来源期刊: 中国组织工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: 组织构建 组织工程 冠心病 血瘀证 遗传 基因组学 生物信息学 国家自然科学基金
• 年，卷（期）: 2014,（51）
• 所属期刊栏目: 技术与方法 -- 组织构建基础实验
• 页码范围: 8337-8345
• 页数: 9页
• 分类号: R318
• 字数: 5643字
• 语种: 中文

摘要

背景：课题组前期通过临床流行病学和分子流行病学显示冠状动脉粥样硬化性心脏病血瘀证具有一定的家族聚集倾向，发现其相关的差异基因与炎症、斑块形成及血管内皮损伤密切相关。<br>　　目的：对冠心病血瘀证遗传相关的差异蛋白基因进行生物信息学分析。<br>　　方法：根据流行病学调查基础上基因芯片技术确定的冠心病血瘀证遗传相关的差异蛋白基因，通过DAVID数据库搜索软件结合GO数据库搜索进行注释和富集度分析；KEGG、BIOCARTA、BBIOD数据库进行信号转导通路分析；VISANT、DIP数据库检索蛋白质相互作用。<br>　　结果与结论：差异蛋白基因主要参与43种生物学过程、3种细胞组分、6种分子途径，差异蛋白主要参与10条信号转导通路，这些蛋白在多条信号转导通路上相互发生作用，发现节点189个，路径映射5个，节点的功能种类包括29类。冠心病血瘀证患者遗传差异基因的功能、通路以及相互作用主要体现在炎症反应、免疫调节、细胞因子趋化、细胞增殖等方面；冠心病血瘀证在多位点、多环节、多种生物学进程中共同发挥作用的复杂病理反应，基因组学生物信息学技术可以站在“整体观”的角度对中医证候的机制作出预测，结合进一步分子生物学验证是一条很好的中医药现代化途径。