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基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别
基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别
作者:
张应爱
张淑芳
曹卉
肖四方
肖敬川
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
膀胱肿瘤
转录组测序
分子标记物
实时荧光定量PCR
摘要:
目的:探讨基于Illumina平台的转录测序筛选出的膀胱癌的候选分子标记物在临床诊断中的可能应用价值。方法:对中南大学湘雅医学院附属海口医院2011-2013年31例膀胱尿路上皮癌和对应的正常组织,采用实时荧光定量PCR对转录组测序筛选出的候选基因进行验证。结果:筛选出的4个候选基因, CDH1、CLDN7、VEGFA和PTPRF在转录组测序患者肿瘤组织相对于正常组织表达上调;实时荧光定量PCR对更多的患者验证发现,CDH1、VEGFA、PTPRF和CLDN7中,VEGFA相对表达水平上调,差异有统计意义(P<0.05),VEGFA和PTPRF表达相对上调,但差异无统计学意义(P>0.05);PTPRF和肿瘤的初发和复发关系比较密切(P=0.002),其预测敏感度和特异度分别为90.0%和83.3%。结论:VEGFA在膀胱尿路上皮癌的发生发展中起重要作用,有望成为膀胱尿路上皮癌的分子标志物,PTPRF有望作为预测膀胱肿瘤复发的分子参考指标。
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文献信息
篇名
基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别
来源期刊
实用医学杂志
学科
关键词
膀胱肿瘤
转录组测序
分子标记物
实时荧光定量PCR
年,卷(期)
2014,(11)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
1745-1749
页数
5页
分类号
字数
4083字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1006-5725.2014.11.020
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张淑芳
中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室
25
55
4.0
6.0
2
曹卉
中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室
12
13
2.0
3.0
3
张应爱
中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室
14
20
3.0
4.0
4
肖敬川
中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室
10
15
3.0
3.0
5
肖四方
中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室
3
1
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参考文献(1)
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参考文献(2)
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2013(4)
参考文献(4)
二级参考文献(0)
2014(0)
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二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
膀胱肿瘤
转录组测序
分子标记物
实时荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用医学杂志
主办单位:
广东省医学情报研究所
出版周期:
半月刊
ISSN:
1006-5725
CN:
44-1193/R
开本:
大16开
出版地:
广州市越秀区惠福西路进步里2号之6
邮发代号:
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
33647
总下载数(次)
22
总被引数(次)
193648
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