百合未授粉成熟雌蕊转录组测序研究

• 作者: 崔金腾 张克中 蔡晓昂 贾月慧
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 百合 未授粉成熟雌蕊 转录组 高通量测序
• 年，卷（期）: 2014,（22）
• 所属期刊栏目: 园艺——研究报告
• 页码范围: 148-154
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在大量发掘百合雌蕊特异表达基因,为研究百合杂交障碍的分子机制提供依据.利用Illumina高通量测序平台,进行百合未授粉成熟雌蕊转录组测序和数据组装,并对获得的Unigene进行功能注释、分类和代谢通路分析.“干柱头”雌蕊LoP1和“湿柱头”雌蕊LoP2分别获得40792条和39708条Unigene.2个样品的Unigene通过序列拼接,去冗余处理,以及同源转录本聚类,得到44175条All-Unigene.基于NR、NT、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG等6个数据库进行相似性比对(E值≤10-5),依次分别有30343、21647、21281、19274、12964和22227个基因被注释.KEGG分析中,19274条All-Unigene被注释到128个代谢通路上.基因分析显示,百合未授粉成熟雌蕊已为授粉受精做好了物质、能量、信号转导以及抗病原等准备工作.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾月慧	北京农学院植科学院	25	439	13.0	20.0
2	崔金腾	北京农学院园林学院	36	148	6.0	11.0
3	张克中	北京农学院园林学院	48	632	15.0	24.0
4	蔡晓昂	北京农学院园林学院	1	4	1.0	1.0