苏铁珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷贝研究

• 作者: SHI Quan-liang 史全良 张青 焦淑静 粟绒 黄现恩
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 共生念珠藻 ITS序列 假阳性 协同进化
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 2853-2857
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2014.15.013

摘要

目的:研究苏铁珊瑚根共生念珠藻16SrDNA-23SrDNA基因间隔序列(ITS)拷贝数.方法:提取苏铁珊瑚根共生念珠藻全DNA,PCR扩增其16SrDNA-23SrDNA基因间隔序列(ITS)克隆并测序;采用Cluster X 1.83对所得序列进行比对,用DNAman软件对比对结果进行人工校正;采用割胶回收电泳检测、菌液PCR及混合模板PCR扩增三种方法验证ITS-L2.结果:ITS-S(420 bp)不合任何氨基酸编码序列,ITS-L1(676 bp)包含一个异亮氨酸和一个丙氨酸编码序列;ITS-L1和ITS-L2在琼脂糖凝胶电泳检测时长度分别为676 bp和1000 bp,而谱带经克隆测序后结果表明ITS-L1和ITS-L2碱基序列和长度几乎相同,仅有两个碱基发生变异.结论:ITS-L2为假阳性,可能是由ITS-S和ITS-L1形成的异源双链;苏铁珊瑚根共生念珠藻含有两种类型的ITS拷贝,一种是含有tRNAIle和tRNAAla编码序列的ITS,另一种是不合tRNAIle和tRNAAla编码序列的ITS.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张青	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	9	40	4.0	5.0
2	史全良	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	25	292	11.0	16.0
3	黄现恩	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	3	10	2.0	3.0
4	焦淑静	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	2	5	2.0	2.0
5	粟绒	苏州大学医学部基础医学与生物科学学院	1	2	1.0	1.0