水曲柳节律相关GIGANTEA基因的克隆及同源性比对分析

• 作者: 方传雷 曹羊 曾凡锁 李明莉 苏秋钰
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水曲柳(Fraxinus mandshurica) GIGANTEA 生物节律 光周期 同源性分析 系统进化树
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 2297-2300
• 页数: 4页
• 分类号: S792.12
• 字数: 3316字
• 语种: 中文

摘要

[目的]对水曲柳节律相关GIGANTEA基因的克隆及同源性进行比对分析.[方法]根据GenBank中GI基因保守结构域设计简并引物,进行PCR分析,并与其他物种的氨基酸序列进行同源性比对分析.[结果]获得了编码区780 bp的部分序列,可以编码260个氨基酸,获得的GI基因命名为FmGI,与多个物种GI基因有着较高的同源性,其中与葡萄、大豆、苜蓿、毛果杨、蓖麻、黄瓜、菊花、大麦、玉米、小麦、拟南芥、黑麦草、洋葱和云杉等多个物种具有较高一致性.系统发育树分析结果表明,GI基因按照单子叶植物、双子叶植物和裸子植物的进化关系聚为3类,明确了水曲柳GI基因的系统进化关系.[结论]该方法对水曲柳生物节律钟GI基因编码区进行了克隆,并对获得的部分GI蛋白序列进行了同源性比对分析,建立了系统进化树,为进一步获得水曲柳GI基因全长及研究其功能起到一定参考作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾凡锁	东北林业大学生命科学学院	49	459	10.0	20.0
2	曹羊	东北林业大学生命科学学院	4	4	1.0	2.0
3	苏秋钰	东北林业大学生命科学学院	3	3	1.0	1.0
4	方传雷	东北林业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	李明莉	东北林业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0