改进MSAP-PCR技术应用于Cd胁迫下拟南芥DNA甲基化分析

• 作者: 何蕾 刘宛 台培东 孙梨宗 宋杰 崔伟娜 王鹤潼 贾春云
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: 甲基化 MSAP-PCR 拟南芥 生物标记物 表观遗传损伤
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 分析方法
• 页码范围: 1618-1624
• 页数: 7页
• 分类号: X171.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11654/jaes.2015.08.027

摘要

全基因组DNA甲基化分析是植物胁迫表观遗传损伤研究的主要方向之一,目前可用手段虽多,然而多数较繁琐,不利于表观遗传损伤的快速诊断.为此应用MSAP-PCR法研究Cd胁迫下拟南芥基因组甲基化变化,并通过优化实验条件、筛选引物(共5条,包括通用引物MLG2和本实验室设计引物AP-1、AP-2、AP-3、AP-4)以及检验多态性和敏感性,综合评估该方法在植物甲基化研究中的应用前景.研究结果发现:该方法模板量选择在150～250 ng并使用4％聚丙烯酰胺凝胶电泳(含50％尿素)分辨PCR产物多态性最佳;该方法对镉敏感性高,在0.2 mg·L-1Cd2+水平就可检测约30个位点的甲基化多态性;引物AP-4对CpG位点甲基化变化最敏感,而AP-3对CHG位点甲基化变化敏感性最高.该方法操作简便、成本低廉、结果准确且敏感性高,可作为植物全基因组甲基化研究的理想方法,以及植物抗逆研究和环境污染早期诊断的生物胁迫标记物.