基于rDNA ITS序列对绒泡菌目黏菌系统发育的探讨

• 作者: 李倩 闫淑珍 陈双林
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 黏菌 核糖体DNA内部转录间隔区 分子进化 最大似然法 贝叶斯分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 424-433
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.140054

摘要

绒泡菌目Physarida是黏菌纲Myxogastria最大的一个目,对其系统发育关系的研究一直是根据形态特征.为了从分子水平探讨绒泡菌目乃至黏菌纲的系统发育关系,以黏菌rDNA ITS通用引物对绒泡菌目5属8种黏菌的rDNA ITS进行扩增和测序,结合GenBank中已有的黏菌rDNA ITS序列,利用贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)构建系统发育树.结果表明:绒泡菌目不同物种的rDNA ITS区在碱基组成和长度上差异明显,长度为777-1 445bp,G+C mol％在53.4％-61.9％之间.绒泡菌目与发网菌目Stemonitida聚类为两个明显的分支,在绒泡菌目分支上,绒泡菌科Physaraceae和钙皮菌科Didymiaceae各聚为一支,支持了形态学上以孢丝是否具有石灰质为依据区分这两个科的观点.由多份不同地理来源的鳞钙皮菌Didymium squamulosum材料组成的钙皮菌科又形成3个分支,证实了这个形态种是由地域来源广泛、繁殖亲和性各异和遗传变异较大的不同生物种组成的复合体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈双林	南京师范大学生命科学学院	71	771	13.0	24.0
2	闫淑珍	南京师范大学生命科学学院	46	471	12.0	20.0
3	李倩	南京师范大学生命科学学院	37	89	5.0	9.0